一、西医对于慢性非细菌性前列腺炎的病因并不十分清楚，目前认为可能存在的因素有:
1.感染因素
(1)支原体感染。
(2)病毒感染。
(2)衣原体感染。
2.非感染因素
（1）前列腺反复充血：认为前列腺反复充血是青少年慢性前列腺炎的原因之一；
(2)尿液回流，因为很多成年男性通过B超检发现前列腺内有结石，但是X无法检出线平片；
(3)免疫因素:许多学者发现慢性前列腺炎患者前列腺液IgA、IgG、IgM特别是升高IgA升高明显;
(4)紧张因素:有研究认为紧张可引起非淋菌性前列腺炎，不用药物、不进行前列腺按摩，而仅仅施行以放松为目的的行为疗法治疗非淋菌性前列腺炎，甚至提出以"紧张性前列腺炎"命名这种疾病。但同样的问题是紧张是开始因素(原因)还是结束表现(结果)，目前还没有足够的依据。
二、中医病因学认为：
1.房间因素:中青年男性思维活跃，性欲旺盛。如果有过度频繁的性刺激，导致阴茎持续勃起，但没有正常完整的射精过程。
2.有过非婚性行为:淋菌性病毒的感觉治疗后期不注意保健。
3.饮食因素:嗜食辛辣刺激性食物，过量饮酒，不仅滋生湿热，还容易引起酒后混乱。
4.日常生活因素:久坐不起开车、办公等；或者少喝水；或者小便忍受。
5、其他不良因素:涉水、淋雨、感冒风寒等。
