一、粪便检测
1、活滋养体检测法:常用生理盐水直接涂层法检测活动的滋养体，典型的阿米巴痢疾粪便为酱红色粘液样，有特殊的腥味，对急性痢疾患者的脓血便和阿米巴患者的稀便进行镜检，粘液中含有集体红细胞和较少的白细胞，有时可以看到活动的滋养体，这些特征与细菌性痢疾的粪便不同，采集标本时，容器清洁，粪便样新鲜
2、包装检查法:临床上常用碘液涂装法，该法简单易行，取干净的载体玻璃，滴入碘液1滴，用竹签取少量粪样，用碘液涂抹薄片盖住玻璃，放入显微镜下检查，鉴别细胞核的特征和数量。
二、阿米巴培养
已有多种改良的人工培养基，常用的如洛克氏液，鸡蛋清，血清培养基，营养琼脂血清盐水培养基，琼脂蛋白胨双相培养基等，但技术操作复杂，需一定设备，且阿米巴人工培养在多数亚急性或慢性病例阳性率不高，一般不宜作为阿米巴诊断的常规检查。
三、免疫诊断
近年来，国内外陆续报告了多种血清学诊断方法，其中间接血凝(IHA)、间接荧光抗体(IFAT)和酶联免疫吸附试验(ELISA)研究较多，但敏感性不同于各种病例，IHA的敏感性高，对肠阿米巴病的阳性率达到98%，肠外阿米巴病的阳性率达到95%，无症状的带虫者只有10%~40%，IFAT的敏感度比IHA稍差，EALSA的敏感性强，特异性高，有发展前途，肠外阿米巴病的阳性
四、血液检测
末梢血白细胞总数和分类多为正常，如有暴发型或继发性细菌感染，白细胞总数和中性粒细胞比例可提高，慢性患者可有轻度贫血。
五、结肠镜检查
多数病例可见大小不等的散在溃疡，其中心有渗出，边缘整齐，周围有时可见1圈红晕，溃疡之间黏膜正常，溃疡边缘部分涂片及活检可见滋养体，通过乙状结肠镜或电子结肠镜直接观察黏膜溃疡，并作组织活检或刮拭物涂片，检出率最高，据报道直肠，乙状结肠有病变的病例约占有症状患者的2/3，因此，凡情况允许的可疑患者都应争取作结肠镜检，刮拭物涂片或取活组织检查，滋养体的取材必须在溃疡的边缘，钳取后以局部稍见出血为宜，脓腔穿刺液检查应取材于脓腔壁部，才较易发现滋养体。
六、钡剂灌肠造影
可见充盈缺损及肠腔较窄，肠壁的阿米巴脓肿及肉芽肿突入肠腔，形成锯齿状阴影。
