不同类型息肉病因不同，炎性息肉是肠粘膜受长期炎症刺激增生的结果，错构瘤型息肉具有家族遗传倾向。
1、长期腹泻
很多患者肠道粘膜容易过敏。例如，饮酒、吃辣椒、油腻的食物或海鲜后腹泻，有些患者无缘无故腹泻，肠道粘膜慢性炎症，肠道息肉容易成长。
2、长期便秘
便秘的病人经常是几天排便一次，粪便长期在肠道内储存会产生各种毒素，导致肠黏膜出现慢性炎症，易 生长息肉。
3、饮食性因素
长期饮食高脂肪、高蛋白、低纤维性饮食者直肠息肉的发生率明显提高，新鲜水果蔬菜和维生素c者的息肉的发生率减少。
4、胆汁代谢紊乱
胃十二指肠溃疡行胃空肠吻合和胆囊切除术后患者，胆汁流动和排出时间发生变化，肠内胆汁酸含量增加。实验显示胆汁酸以及胆汁酸的代谢产物脱氧胆酸和石胆酸均有诱发结直肠黏膜产生腺瘤性息肉或癌变的作用。
5、遗传
例如家族性息肉病就是一种遗传疾病。
6、肠道炎性疾病
结肠黏膜的慢性炎症病变是导致炎症性息肉发生的主要原因，最多见于慢性溃疡性结肠炎、克罗恩病以及阿米巴痢疾、肠道血吸虫和肠结核等，也见于结肠手术后吻合口部位。
