(1)发病原因
1、原发性十二指肠炎的原因尚未完全明确，可能与饮食刺激性食物、饮酒、药物(例如非固醇抗炎药物)、幽门螺杆菌感染等有关，本病也可能伴随十二指肠其他疾病和肝胆胰等周围器官疾病，与慢性胃炎、消化性溃疡等合并，因此认为十二指肠炎可能与其原因相同，十二指肠炎可能发生十二指肠溃疡，其依据是
(1)炎症开始时酸度正常
(2)十二指肠炎时表皮细胞因炎症破坏而丧失，但腺管部细胞增殖可补偿，腺管细胞衰竭无法补偿丧失时，可产生糜烂，形成溃疡。
2、特异性十二指肠炎多由克罗恩病、肠结核、寄生虫(钩虫、兰氏贾第鞭毛虫等)和真菌、嗜酸粒细胞性肠炎等引起特异性炎症。
(2)发病机制
十二指肠粘膜充血、浮肿、糜烂、出血、腺体减少、绒毛萎缩的粘膜层和粘膜下层炎细胞，淋巴细胞、浆细胞、单核细胞浸润，根据其炎症程度和分布，分为浅表性、间质性和萎缩性3种。
1、浅表性这种类型最常见，约占50%~80%，炎症仅限于绒毛，绒毛短，钝化或畸形，上皮细胞退化，细胞平坦，细胞质出现空泡，核染色稀疏或固化，刷状缘薄，绒毛间充满炎症细胞
2、间质性炎症细胞浸润主要见于接近粘膜肌层的肠腺隐藏巢，有时与固有层整体有关，伴有淋巴滤泡增生。
3、萎缩性 黏膜变薄，绒毛显示不同程度的萎缩，常有重度的上皮细胞退行性变，并见大片脱落，从而出现糜烂，有时见胃上皮化生；肠腺减少甚至消失，杯状细胞，黏液细胞及嗜银纤维增生，黏膜肌层断裂，增生，肌纤维有退行性变；固有层有广泛的炎性细胞浸润，主要为淋巴细胞，浆细胞，并有淋巴滤泡增生。
