1、一般治疗:包括饮食、锻炼、改变坏习惯等。对于没有器质性病变的普通人来说，饮食疗法优先，在饮食中增加面筋糠、水果、蔬菜等纤维食物的运动训练有助于普通人的排便，长期卧床不起的患者经常便秘堵塞生活中的紧张感，缓和工作节奏，纠正长期忍耐等不良习惯，对便秘者也很重要。
2、药物治疗:尽管采用上述方法，但许多便秘者仍需使用腹泻药辅助排便。一般便秘者偶尔使用腹泻药不会产生不良后果，但长期使用腹泻药可能会引起依赖。腹泻药一般分为刺激性腹泻药(例如大黄、腹泻叶、酚邻苯、希麻油)、盐性腹泻药(例如硫酸镁)、渗透性腹泻药(例如甘露醇)、膨胀性腹泻药(例如面筋、芋粉、琼脂制成的充肠剂)、润滑性腹泻药(例如蜡油)。
根据便秘的重量，选择腹泻剂重要。慢性便秘以膨胀性腹泻剂为宜，必要时选择刺激性腹泻剂，不得长期服用急性便秘可选择盐类腹泻剂、刺激性腹泻剂和润滑性腹泻剂，但时间不得超过1周，对于长期慢性便秘，特别是引起粪便堵塞的人，可以使用灌肠方法，灌肠液分盐水和肥皂水
3、粪便堵塞治疗:通常使用灌肠、口服泻药、开塞露肛门等方法，无效。 可采用手法挤压肛周，女性可用手指压迫阴道后壁助便。临床上常用的治疗便秘的方法是将食指(戴手套)插入肛门，将干粪团分成小块，挖出或加入开塞露刺激排出，无效时在局麻下挖出粪团。
4、水疗法:这是治疗顽固性便秘的有效新疗法。通过仪器，将灭菌净化的盐水不断地注入肛门，经过反复清洗，使积存在大肠内的粪便排出，达到清除肠内毒物、细菌和寄生虫，恢复肠道正常吸收和排出功能的目的。与口服泻药和普通洗肠不同的是，这种治疗便秘的方法不痛苦，清洗彻底，适用于各种便秘，具有排毒养颜的效果。一般每1~3月1次，每次45分钟。
