巧克力囊肿不是恶性肿瘤，卵巢巧克力囊肿指子宫内膜组织异位到了卵巢，因受到体内雌孕激素变化的影响，出现类似于月经的周期性出血，从而形成的一种包裹性囊肿。它本质上是一种子宫内膜异位症，不是恶性肿瘤。
患有卵巢巧克力囊肿的女性会出现下腹痛、痛经、不孕、性交不适及月经异常等症状，症状较轻时可予以药物治疗，囊肿较大或需要恢复生育功能者则可能需要手术治疗。具体治疗方案，建议咨询专业医生。巧克力囊肿目前通过手术加药物方法治疗，绝大多数患者可以治愈。
巧克力囊肿是激素依赖性疾病，与经血逆流，慢性炎症反复刺激，遗传，自身免疫因素等有关。腹腔镜加组织检查是确诊巧克力囊肿的最佳方法，医生也可以询问病史及临床表现，B超，血清CA125的测定诊断巧克力囊肿。
出现继发性痛经进行性加重，也可能是其他疾病，如子宫腺肌症，应及时去医院就诊，请医生明确诊断和治疗。
