慢性腹泻的常见并发症为营养不良和维生素缺乏症，与长期性大便次数增多和营养流失有关。同时会导致抵抗力下降，而出现真菌性肠炎一类继发性感染疾病。部分患者可能会并发中毒性肝炎，还可有电解质紊乱及肠出血的可能性，严重时会导致肾衰竭。
慢性腹泻是病程相对较为漫长的一种疾病。几乎所有患者在发病之后都会持续性出现拉肚子症状，即便是及时用药治疗，也不能在较短时间内彻底性治愈。而有些患者却不以为然，可能会不着急接受治疗，这样就容易引起并发症。那么，慢性腹泻会导致哪些并发症呢？
1、营养不良
慢性腹泻在长时间得不到缓解的情况下，很容易引起营养不良。由于大便次数明显增多，水分及各种营养物质丢失量比较大，久而久之就会出现身体消瘦和疲乏无力等全身性不良反应。而此时就算是改善饮食结构，增加营养补充，也很容易出现营养不良类病症。
2、维生素缺乏症
慢性腹泻可导致肠胃蠕动速度加快，会促使维生素流失，进而可造成恶性循环，出现维生素缺乏症。其中在临床方面比较常见的有维生素A缺乏和维生素D缺乏，严重时可因此产生干眼症及手足抽搐症。
3、继发性感染
对于患有慢性腹泻的人群来说，很容易发生继发性感染。由于腹泻发生期间可导致全身抵抗力大大下降，特别是迁延性腹泻，极有可能引起真菌感染，可出现鹅口疮或真菌性肠炎一类炎症疾病。另外，也有患上上呼吸道感染、泌尿道感染以及口角炎的可能性，有时也会诱发难以治愈的败血症。
4、中毒性肝炎
中毒性肝炎属于慢性腹泻常见并发症。尤其是重型腹泻发作期间可导致黄疸，出现皮肤及眼睛巩膜黄染现象，且可伴随有肝脏区域疼痛不适感。
5、其它并发症
慢性腹泻可导致电解质紊乱，出现低钾症或低钠症。若处理方法不当可发生肠出血或肠套叠等大肠疾病，偶尔也会发生肠穿孔。而在情况极为严重时，还会有出现急性肾功能衰竭和心力衰竭的可能性。
