咳嗽有痰扁桃体发炎咽喉肿痛，可应用抗生素、解热镇痛、糖皮质激素类药物改善，或应用含片、喷雾、含漱液等药物辅助治疗。
扁桃体炎症是由于致病微生物引起的感染性疾病，多数患者发炎可合并细菌感染，需通过血常规检测确定患者感染程度，若确定患者白细胞、中性粒细胞等炎症指标有所升高，需给予抗生素药物抗感染治疗。临床常用抗生素包括青霉素类药物（阿莫西林）、头孢菌素类药物（头孢呋辛、头孢他啶）等。
咽喉肿痛过于严重，或伴有高热、咳痰等症状，可应用解热镇痛类药物，或应用糖皮质激素治疗，如布洛芬、塞来昔布、美洛昔康等。也可使用含片、喷雾、含漱液等药物，保持口腔和咽喉部清洁，帮助排除咽喉部粘液。
