C反应蛋白主要是查体内是否存在炎症，同时鉴别是否受到了细菌感染。临床中，C反应蛋白检查常与血常规检查同时进行，用于呼吸道感染疾病的明确诊断。此外，C反应蛋白也可用于检查组织损伤以及损伤程度。
C反应蛋白属于炎症标志物，当机体出现急性炎症、细菌感染和组织损伤时，血清中的C反应蛋白值就会急剧上升。当患者出现呼吸道感染症状以及体温升高时，可检查C反应蛋白值，并结合血常规中的白细胞、中性粒细胞计数，进行细菌感染和病毒感染的鉴别与诊断，从而针对性用药。通常，细菌感染会引起C反应蛋白值明显增高；而病毒感染时，C反应蛋白可轻度升高或无明显变化。
此外，C反应蛋白还可以查手术创伤、外伤性组织损伤、放射性损伤的恢复程度，当组织损伤出现好转或完全恢复，C反应蛋白值会迅速下降或恢复正常。心肌梗塞患者，可通过C反应蛋白查出病情的严重程度。
