一般情况下，结节性甲状腺肿的原因有接触致甲状腺肿物质、缺碘、激素合成障碍。具体分析如下：
1.接触致甲状腺肿物质：导致结节性甲状腺肿大的原因，可能和长期接触致甲状腺肿的物质有关，比如一些萝卜族的食物中有一种叫硫脲类的物质，该物质会导致甲状腺肿大。而白菜、黄豆中也有阻止甲状腺激素合成的物质，从而诱发甲状腺肿大的情况发生。服用了一些阻碍甲状腺素合成的药物和释放的药物，比如硫氰化钾、磺胺类、秋水仙素等，也会导致甲状腺肿。
2.缺碘：缺碘也会导致甲状腺肿，在甲状腺疾病的高发区，当地的食物、土壤、水当中的碘含量都较低。而对于碘化食盐的摄入可以预防甲状腺肿大的事实，也能证明缺碘的确可能诱发甲状腺肿大。另外，机体对甲状腺激素需求量增多的时候，如果患者体内相对碘不足，也是会加重或者是诱发甲状腺肿大。
3.激素合成障碍：甲状腺肿也呈家族聚集性，这是由于遗传酶的缺陷导致的。如果缺乏过多的脱碘酶和过氧化酶，就会造成加速合成障碍，进而影响到甲状腺素的合成。或者缺乏水解酶，也会导致甲状腺激素释放入血发生困难，进而互相甲状腺肿的情况。而对于这类先天性缺陷，都属于隐性遗传的一种。
除了以上原因，基因突变同样会导致甲状腺肿，主要是包括甲状腺球蛋白基因突变。
