肛乳头瘤一般无法自愈。瘤体较小，病情较轻，可通过温水坐浴及局部外用药物方式治疗。瘤体较大，通常做手术治疗。
肛乳头瘤是一种良性肿瘤，可是一旦形成，不加以治疗症状有可能加重。有些严重肛乳头瘤还有可能引起肛瘘等严重并发症，肛乳头瘤不能自愈。需要及时进行正规治疗。
如果肛乳头瘤瘤体较小，并没有引起明显肛门不适，可以通过温水坐浴方式缓解病情，也可以在局部外涂能消肿止痛药液。如果肛门乳头瘤瘤体较大或病情严重，通常采用手术方法治疗。面对较大肛乳头瘤，手术结扎时应贯穿做“8”字缝扎，这样可以防止结扎线滑脱及大出血。
