黄曲霉菌是绿色，也有一部分是黄绿色，这是肉眼可见的颜色。黄曲霉菌初期滋生时颜色为白色，无法用肉眼观察到。
黄曲霉菌能用肉眼看到的颜色通常为绿色或者黄绿色。黄曲霉菌滋生时，菌落正面的色泽为白色，随着其不断生长和繁殖，逐渐变成黄色，之后会变成黄绿色或绿色，呈半绒毛状，孢子成熟之后的颜色是褐色。孢子的表面平坦，也有一部分会带有放射状的沟纹，孢子反面无色或者为褐色。
黄曲霉菌很容易污染粮油食品，比如花生、大米、小麦、玉米、豆类、坚果类以及乳制品等，其中玉米以及花生受到的污染最为严重，在高温以及高湿的环境当中，黄曲霉菌会生成黄曲霉毒素，这种毒素属于致癌物，容易引起黄曲霉毒素急性中毒，导致恶心、呕吐、黄疸以及肝区疼痛等症状，严重时会造成胃肠大出血，导致死亡。
