皮下脂肪瘤没有后遗症，但是在手术切除后容易损伤周围组织，引起顽固性消化不良、营养不良。
1、移位、复发
皮下脂肪瘤有很少有其他并发症，但是体积较大，进行手术时受到手术刺激，脂肪瘤有可能会发生异位、复发，体表内脂肪瘤则可向心脏等内脏器官转移。
2、损伤周围组织
手术切除皮下脂肪瘤过程中手术麻醉出现意外，有可能会损伤周围大血管、神经、组织以及其他相邻器官而而引起局部病变。有部分患者在手术切除后可伴有脂肪瘤切除后综合征。
3、消化不良、营养不良
消化不良具体症状表现为：恶心呕吐、食欲不佳、厌油、顽固性腹胀、腹泻等；营养不良则表现为全身乏力、嗜睡、脸色苍白、精神倦怠等。这些并发症无明确性治疗方案，多数患者在术后1~2个月左右逐渐缓解。
