白塞氏病的治疗通常以药物治疗为主，需要服用药物时间长短不一。多数患者需要较长期服药，主要是免疫调节药或免疫抑制药，包括外用药物、口服糖皮质激素、甲氨蝶呤、吗替麦考酚酯和抗肿瘤坏死因子拮抗剂等。白塞氏病具体的药物治疗方法详见以下介绍：
1、苯丁酸氮芥(Chlorambucil,
CB1348)：用于治疗视网膜，中枢神经系统及血管病变，用法为2mg
3/d，持续使用数月直至病情控制至稳定，然后逐渐减量至小量维持，病情完全缓解半年后可考虑停药。但眼损害应考虑用药2~3年以上，以免复发。
2、硫唑嘌呤(Azathioprine)：用量为2~2.5mg/kg/d，可抑制口腔，眼部病变和关节炎，但停药后容易复发，可与其他免疫抑制剂联用。
3、甲氨蝶呤(Methotrexate)：每周7.5~15mg，口服或静注用药，用于治疗神经系统，皮肤黏膜等病变，可长期小剂量服用。
4、环磷酰胺(Cyclophosphamide)：在急性中枢神经系统损害或肺血管炎，眼炎时，与泼尼松联合使用，可口服或大剂量静脉冲击治疗(每次用量0.5~1.0/㎡体表面积，每3~4周一次)，使用时嘱患者大量饮水，以避免出血性膀胱炎的发生。
