药物治疗前列腺炎主要是为了缓解症状，达到治疗的目的。若前列腺炎是由细菌感染引起的，可采用抗生素治疗。 如果前列腺炎不是由细菌感染引起的，抗生素对治疗效果不大。最常用的三种药物是抗生素α-其体阻滞剂和非甾体抗炎镇痛药对缓解症状也有不同程度的疗效。
抗生素：治疗维持4-6周
目前，在治疗前列腺炎的临床实践中，最常用的一线药物是抗生素，但只有大约5%的慢性前列腺炎患者有明显的细菌感染。根据细菌培养结果和药物穿透前列腺包膜的能力选择抗生素。常用的抗生素是氟喹诺酮类药物，如环丙沙星、左氧氟沙星和洛美沙星。抗生素治疗至少维持 4-6 周，患者应分阶段进行疗效评估。如果对疗效不满意，可以使用其他敏感抗生素。
α-受体阻滞剂：疗程超过12周
α-受体阻滞剂可以放松前列腺和膀胱的平滑肌，改善下尿路症状。郭正辉博士说，推荐使用α-受体阻滞剂主要有:特拉唑嗪、阿夫唑嗪、多沙唑嗪、坦索罗辛和萘哌地尔等。治疗中应注意该类药物导致的眩晕和体位性低血压等不良反应。疗程至少应在 12 周以上。
非甾体抗炎镇痛药：主要是缓解疼痛
非甾体抗炎镇痛药是治疗前列腺炎相关症状的经验性药物。其主要目的是缓解疼痛和不适。
对于抑郁、焦虑的慢性前列腺炎患者，在治疗前列腺炎的同时，可选择使用抗抑郁药和抗焦虑药。
