1、前列腺炎、睾丸炎、睾丸炎、尿道炎等生殖道感染，严重者影响男性生育能力。
2、染色体异常，常见的有男假两性畸形、Klinefelter综合征和XYY综合征、46XY/47XXY等染色体异常导致睾丸生精障碍。
3、精子结构异常和精浆异常，可影响精子运动、获得能力和顶体反应等。
4、男性性功能障碍、勃起功能障碍、早泄、不射精和逆行射精可能导致男性不育。
5、输精管道阻塞、先天性和后天性阻塞影响精子运输不育。
6、内分泌疾病、下丘脑功能障碍、Kallmann综合征等，主要是促性腺激素释放激素不足的垂体功能障碍，如选择性黄体生成素(LH)缺陷症和尿促性素(FSH)缺陷症、高泌乳素血症等。肾上腺皮质增生症可抑制垂体分泌FSH、LH，导致不育。
7、免疫性不育，男性自身产生的抗精子抗体和女性产生的抗精子抗体均可影响精子活力及对卵子的穿透力。
8、药物因素:常见的有西米替丁、柳氮磺吡啶、雷公藤、螺内酯、呋喃西林、尼立达唑、秋水仙素、各种激素类药物和癌症化学治疗药物，如烷基化合物，往往会造成暂时或永久对精子的损害。
9、睾丸生精功能异常，睾丸、睾丸、睾丸、病毒性睾丸炎、精索静脉曲张、毒素、磁场、高热、外伤等理化因素可引起睾丸生精障碍。
10、不良的生活习惯和工作因素。长期穿紧身裤、嗜烟、酗酒、接触有毒物质、热水浴频繁、房事不当或频繁、长途、过度劳累、骑自行车、放射线损伤等。
11、手术因素，如尿道瓣膜手术、尿道梗阻施行的膀胱颈切开术、腹膜后淋巴结清除术或较大腹膜后手术，均可引起逆行射精或射精障碍，导致不孕。
12、其他纤毛滞留综合征表现为患者儿童时期患慢性呼吸道疾病，成年后精子尾部纤毛异常，精子向前游动能力弱。
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