在甲状腺三种主要的抗体中，抗甲状腺过氧化物酶抗体和抗甲状腺球蛋白抗体，这两种抗体持续存在，是维持自身免疫性炎症，疾病呈慢性特征的关键因素，是自身免疫性甲状腺炎的重要诊断指标，对于甲状腺炎、甲状腺结节、甲状腺癌、甲状腺功能亢进症、甲状腺功能减退症等都有一定的检测价值。
抗甲状腺过氧化物酶抗体和抗甲状腺球蛋白抗体高，代表着患者自身的免疫系统出现了紊乱，导致这两种抗体被错误地生产过多，与甲状腺细胞产生严重的对抗。
抗甲状腺过氧化物酶抗体(TPOAb)、抗甲状腺球蛋白抗体(TgAb)阳性是确定原发性甲状腺功能减退症病因的重要指标。甲状腺过氧化物酶抗体增高，甲状腺功能中促进甲状腺激素增高，甲状腺激素减少等，考虑到存在自身免疫性甲状腺功能减退症。甲状腺功能减退症是由于甲状腺激素合成和分泌减少而降低身体代谢的内分泌疾病，可根据病因、临床表现进行甲状腺功能检查等诊断。
抗甲状腺球蛋白抗体与抗甲状腺过氧化物酶抗体不同，抗甲状腺球蛋白抗体上升难以追溯原因，抗甲状腺球蛋白抗体上升的原因不单一，多数情况下抗甲状腺球蛋白抗体上升。根据甲状腺球蛋白抗体的判断，需要结合甲状腺功能和超声波等综合检查方式进行判断。
此外，还有一些非疾病原因，比如自身免疫力下降，或者服用一些药物，可以出现甲状腺过氧化物酶抗体和抗甲状腺球蛋白抗体高的情况，如转移因子、薄芝糖肽等。因此，在两种抗体升高的情况下，仍需检查甲状腺激素的情况后，综合判断，建议定期检查和综合治疗时，注意饮食，不要吃含碘量高的食物。
