1、15%的人接种疫苗后不能产生抗体，一般接种疫苗后2周左右产生抗体，另外约15%的人对疫苗中含有抗原的刺激反应不敏感，也不能产生抗体，不能达到预防流感的目的。
2、流感病毒每年都会发生变异，流感病毒股几乎每年都会发生变异，医药研发人员每年都会根据当年的病疫情情况、病毒变异的可能结构来配制不同的疫苗。在流感流行的季节，病毒株发生变化，疫苗无法提供有效的保护。
3、流感疫苗对普通感冒没有用，流感和我们平时说的感冒有很大区别。普通感冒是由多种病毒和细菌引起的，临床表现为鼻塞、流涕、打喷嚏、咽痛、声音嘶哑、流泪等常见症状，约3~5天痊愈，不流行，预后良好。
流感是由流感病毒引起的，临床表现为高热、头痛、寒颤和干咳、全身乏力、四肢酸痛、厌食等，一般要持续一两周。流感可引起支气管炎、肺炎、中耳炎、心肌炎、心包炎、中枢神经系统异常等多种并发症，甚至死亡。
流感疫苗只针对甲、乙、丙三型流感病毒引起的感冒，但不针对其他病毒和细菌引起的普通感冒，只能缓解普通感冒的症状，缩短周期。
