(一)病因
原发性低磷酸盐血症性佝偻病的病因主要与遗传有关。本病是一种性连锁显性遗传病。遗传缺陷异常因素主要发生在X染色体或常染色体隐性遗传上。患者通常有家族史。有些是散发性患者，病因不明，可能是这些患者身体各个部位的一些间质肿瘤。
(二)发病机制
这种疾病的发病机制尚不完全明确，过去被认为是维生素D代谢异常或肠道钙吸收障碍引起的，但血液1、25(OH)2D3.水平正常，不能纠正低血磷和尿磷排出过高，证据不足。目前认为肾小管本身有功能缺陷，可能缺乏磷结合蛋白，影响肠肾小管上皮磷的正常转移。一般认为遗传者可能是磷转运系统，对甲状旁腺素有特殊的遗传缺陷，合成1、25(OH)胆骨化醇功能障碍，肾小管对磷的吸收减少，尿磷增多，导致血磷下降。由于肠道对钙的吸收减少，血液(Ca)×(p)骨钙化的聚减少，导致低钙血症、继发性甲状旁腺功能亢进和骨钙化功能不全，导致佝偻病或骨软化。巨细胞肿瘤(良性或恶性)、修复性肉芽肿、血管瘤、纤维瘤等继发性疾病可能会损害近端肾小管25(OH)D的1α-羟化和磷酸盐的转移增加了肾磷酸盐的去除，导致骨软化和低磷酸盐血症。在上述因素的影响下，最终导致生长发育障碍和明显骨病。
