天生两只眼睛颜色不一样可能是由于虹膜异色综合症、双眼晶状体密度病变等原因造成，治疗可采用日常注意保护眼、微创玻璃体视网膜手术等，具体如下：
虹膜异色症是一种身体的异常，是指天生两只眼睛的虹膜颜色不同，主要是由虹膜组织的色素沉淀和分布所决定，因此在形成过程中任何因素影响以上的色素分布，就会出现不同的颜色。先天虹膜异色综合症患者无须进行治疗，日常生活中要注意保护眼睛，避免长时间使用电子设备，保持良好的生活作息。
这种情况有可能是先天性发育不良，也有可能由于双眼晶状体老化造成，比如白内障等，会造成双眼的色彩不均衡，从而产生色差。治疗双眼晶状体密度病变可采用微创玻璃体视网膜手术治疗。
天生两只眼睛颜色不一样的患者，不必担心，在医院查明病因，及时治疗。
