甲型流感病毒能否自愈，不可一概而论。轻型和普通型感染，通常可以自愈，重型感染一般不能自愈。
甲型流感病毒感染的预后与病毒的毒力以及自身的免疫力关系较大，如果是轻型和普通型感染，病情通常不严重，只出现轻微的上呼吸道症状，没有明显的发热或者呈轻微低热，咽部略微红肿，这种情况有自愈的可能。若身体抵抗力和免疫力比较强，本身并没有基础性疾病，患有轻型和普通型甲型流感，病情通常能在1~2周左右痊愈，无需特殊治疗。
如果发生重型流感，临床症状表现比较明显，大多数患者都会出现持续高热不退的现象，甚至还会出现呼吸衰竭或者多器官衰竭，并发细菌性肺炎、休克等。此时病情非常严重，如果不及时治疗，病情会进一步加重，不仅不能自愈，还会危及患者的生命。重型流感多发生在老年人、有慢性病的人群或者婴幼儿人群当中，这类人群免疫力差，受到甲型流感病毒感染后，易发展成重症。
