由于许多晚期非小细胞肺癌患者采用的化疗方案都是经验处方未经选择的， 所以相当一部分非小细胞肺癌患者的化疗疗效不令人满意，效果不好。两药含铂的一线化疗方案化疗几个周期后，肺部病变非但没有缩小，反而增大了.我们临床称之为“病变进展”了，医学专业名词称之为"PD"。
一线药物化疗失败后的治疗我们称之为“二线治疗”。
二线治疗包括二线化疗和二线靶向治疗。二线化疗药物包括了泰索帝(多西紫杉醇)和力比泰(培美曲塞)， 二线靶向药物包括了易瑞沙和特罗凯，这几年会还有更多的化疗和靶向新药物新方案应用于临床。
为了避免非小细胞肺癌一线化疗的盲目性，许多有胸外科医生参与的肺癌中心是通过手术切除、或CT引导下穿刺肺活检(TTNA)、或超声纤维支气管镜病灶活检(EBUS-TBNA)、或体表淋巴结活检术、或电视纵隔镜淋巴结活检、或通过电视胸腔经镜活检获取肿瘤组织，通过病理科获得了准确的肺癌病理诊断，明确了肺癌的病理类型。
再通过检测肺癌相关基因，明确该肺癌患者对于哪几个化疗药物会有效，最后确定肺癌化疗药物或靶向药物组合的治疗方案。目前提倡的非小细胞肺癌在基因检测指导下的个体化化疗或靶向治疗的治疗模式，在明显提高药物治疗效果的同时，也最大限度地减少了政府和社会广为关注的“过度治疗”。
不论是一线治疗或二线治疗，我们都希望各地肺癌中心的胸外科医生同肿瘤内科医生一起讨论，根据肺癌患者年龄、一般状况评分、主要脏器功能情况、肺癌病理类型和基因检测结果，制定化疗或靶向治疗方案。当然还要考虑患者的经济状况。
