核酸检测可选择自己想要的方式进行检测，其包括咽部、鼻腔及肛门分泌物检测，但主要以咽拭子检测为主。
核酸检测可以通过检测呼吸道分泌物，也可以通过粪便检测，重症患者可以用支气管肺泡灌洗液进行检测，患者可根据自身情况选择不同的检测方式。新型冠状病毒以呼吸道繁殖最为常见，所以通过口、鼻腔采集咽喉部位的上皮细胞进行检测，其准确率较高。如出现鼻黏膜出血等突发情况，可进行咽拭子、肛拭子检测，其检测结果可分为阴性和阳性。
其次，也可根据自身出现的症状选择检测方法，部分新型冠状病毒患者出现呕吐、腹泻等消化道症状，此时也可通过肛门分泌物进行肛拭子核酸检测，是否感染新型冠状肺炎病毒的唯一判断标准即为核酸检测，但其也可能存在一定程度的假阳性和假阴性，如为具有流行病学史者，通常在第一次检测结果阴性后，间隔24小时以上还需进行二次检测，两次结果均为阴性时，方可解除隔离。
