HPV疫苗类型不同，第2针的接种时间不同，一般接种完第1针HPV疫苗后，第2针HPV疫苗的接种时间最晚不要超过规定时间的2周。
目前接种的HPV疫苗，有二价HPV疫苗、四价HPV疫苗和九价HPV疫苗三种类型。这三类疫苗都需分3次接种，二价HPV疫苗的接种时间分别是0、1、6个月，即接种完第1针HPV疫苗后，间隔1个月接种第2针HPV疫苗。最好按照规定时间按时接种疫苗，但接种时出现了感冒发烧、尿道感染等疾病，或处在生理期时，因特殊情况需推迟接种，推迟时间最好不要超过2周，否则会影响体内抗体的形成，从而降低接种HPV疫苗后的防御效果。
四价HPV疫苗和九价HPV疫苗的接种时间相同，三针接种时间分别是0、2、6个月，即接种完第一针HPV疫苗后，需在2个月后接种第2针。与二价HPV疫苗一样，如因特殊原因需要推迟，最多不要超过2周，否则会降低HPV疫苗的效价。
