肛周疼痛的症状主要表现是肛门的内部以及肛门直肠周围疼痛为主的一种症状，为多种肛门直肠疾病所共有。而其疼痛的性质、程度以及伴随症状各有所异。轻视肛周疼痛的治疗也会延误导致肛周疼痛的疾病的治疗，造成严重的后果。
（1）肛裂
引起的疼痛，呈周期性，多发于大便时或大便后，主要由粪便刺激，溃疡裂口扩张所致。其疼痛为阵发性灼痛或刀割样疼痛，可持续数分钟；待粪便通过后，疼痛减轻。另外，由于排便的刺激，内括约肌可呈持续性痉挛，引起溃疡裂口剧烈而持久的疼痛；往往可持续数小时之久，患者坐卧不安，十分痛苦；严重者可疼痛24小时以上。除了疼痛，肛裂者常伴有出血、便秘等症状。
（2）肛窦炎
一般为肛门部微痛、坠胀，排便时因粪便压迫发炎的肛窦而致肛门部灼痛，若括约肌因受刺激而挛缩，疼痛则加剧，并向臀部及股后部放射。常伴有少量脓性或粘液性分泌物外溢、气味臭，日久可致肛周潮湿、瘙痒等不适。
（3）血栓性外痔
轻者有异物感，大多伴有胀痛。由于肛周静脉血管破损，血块凝结而成血栓，在肛门外皮下出现青紫圆形硬结节，一般在截石位3点、9点处。
