根据新型冠状病毒数据库目前共享的信息显示，奥密克戎变异株的突变位点数量，明显多于近2年流行的所有新型冠状病毒，尤其在病毒刺突蛋白突变较多。推测其出现的原因可能有三种情况，大量突变、动物感染后病毒突变、进化代谢没有及时发现。
1.大量突变：免疫缺陷患者感染新型冠状病毒后，在体内经历了较长时间的进化累积了大量突变，通过偶然机会传播。
2.动物感染后病毒突变：某种动物群体感染新型冠状病毒，病毒在动物群体传播过程中发生适应性进化，突变速率高于人类，随后溢出传染到人类。
3.进化代谢没有及时发现：该变异株在新型冠状病毒基因组变异监测落后的国家或地区持续流行了很长时间，由于监测能力不足，其进化的中间代次病毒未能被及时发现。
