单纯疱疹病毒2型主要存在于女性宫颈、阴道、外阴皮肤及男性的阴茎、尿道等处，是引起生殖器发炎和疱疹主要原因，男女双方都有可能感染，是引起生殖器发炎和疱疹的罪魁祸首。
生殖器疱疹HSV感染后平均约4～5日，外阴患部先有灼热感，旋即发生成群丘疹，可为一簇或多簇，继之形成水疱。数日后演变为脓疱，破溃后形成糜烂或浅溃疡，自觉疼痛，最后结痂自愈。
据有关统计资料显示，生殖器疱疹的病原体90%为Ⅱ型疱疹病毒，仅10%为Ⅰ型疱疹病毒。经性器官接触后，潜伏约2-20天，有免疫缺陷或免疫功能不全的人，如应用免疫抑制剂、肾移植、严重烧伤、重度营养不良、血液淋巴系统恶性肿瘤病人等感染后症状加重，可出现疱疹性湿疹、复发性角膜溃疡，甚至全身播散性疱疹而致命。
感染1-3周后体内产生中和抗体及补体结合抗体，残存的病毒可能向周围神经沿神经轴转入三叉神经节或骶神经节，而长期潜伏，进入静止状态。
当某种诱发因素如焦虑、精神创伤、受凉、日晒、吹风、创伤、感染、药物过敏、高热、月经、妊娠等破坏身体生理平衡时，神经细胞中出现病毒增殖所需的特异性转录酶，激活病毒而引起复发，体液抗体并不能制止疱疹病毒复发，细胞免疫减弱对复发有重大影响。
