若不治疗，大约70%～80％的患者是致命的，并且急性发病存活者常遗留严重的后遗症。早期诊断和治疗是降低本病病死率的关键，主要包括特异性的抗病毒治疗，辅以免疫抑制剂治疗和对症支持治疗。
1.、抗病毒化学药物治疗
1）阿昔洛韦（Acyclovir）：第二代抗病毒药物，系鸟嘌呤的衍生物，通过抑制DNA多聚酶的作用，抑制病毒DNA复制，进而导致病毒结构蛋白（γ类多肽）合成受阻，从而发挥抗病毒作用，具有很强的抗HSV的作用。
常用剂量为：婴儿（大于6月龄）HSE为500mg/m2，静脉滴注，每8小时一次，疗程10天。成人30mg/kg/日，分3次静脉滴注，连用14～21天，少于10天常有复发。国际推荐治疗时间为21天，若病情较重可延长治疗时间或再治疗一个疗程。
2）更昔洛韦（Ganciclovir）：抗HSV的疗效是阿昔洛韦的25～100倍，具有更广谱的抗HSV作用和更低的副作用。用量是5～10mg/kg/日，静脉滴注，疗程10～14天。
2、免疫抑制剂治疗
1）干扰素及其诱生剂 ：干扰素是细胞经病毒感染后产生的一组高活性糖蛋白，具有广谱的抗病毒活性，而对宿主细胞损害极小，60×106IU/日，连续肌肉注射30天；聚肌胞可使人体产生足量的内源性干扰素。
2）转移因子：可使正常淋巴细胞致敏而转化为免疫淋巴细胞，皮下进行注射，1～2次/周，每次1支。
3）肾上腺皮质激素 ：对病情危重、头颅CT有出血性坏死灶及脑脊液红细胞和白细胞明显增多者可酌情使用。
3、全身支持治疗
对重症及昏迷患者至关重要，注意维持营养及水、电解质的平衡，保持呼吸道通畅。必要时给予静脉高营养、加强生活护理，预防褥疮及呼吸道感染等并发症。
4、对症治疗
包括对高热的患者进行物理降温，抗惊厥、镇静、脱水降颅压等。
