肾盂肾炎和膀胱炎是两种不同器官组织的疾病，但有时有明显的尿道刺激症状、尿频、尿急、尿痛、实验室检查显示尿中有白细胞和红细胞，尿细菌检查阳性。因此，做好两者之间的鉴别诊断对治疗尤为重要。
首先，肾盂肾炎多为女性发病者，患者一般有尿路结石梗阻史或膀胱-输尿管反流的急性膀胱炎没有性别、年龄差异，男女都可以发病。女性患膀胱炎的原因多与妇科炎症有关，男性与前列腺疾病有关。其次，肾盂肾炎的发病率远低于膀胱炎。肾盂肾炎发病时常有非常明显的全身症状，主要以体温上升、白细胞总数和中性粒细胞上升为典型特征，患者常伴有发热、怕寒、筋骨疼痛、头痛、恶心等症状。但膀胱炎除了严重的尿路刺激征集(尿频、尿急、尿痛)和排尿时有强烈的尿道烧灼感外，没有明显的全身症状，只要身体没有其他患者，血液常规就没有明显的异常，膀胱炎患者完全可以照常工作和学习。
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