男性不育症的治疗要根据病因，有的放矢。不育者在查明病因后，应根据自己的经济条件和医生意见，选择适合自己的方法，逐步治疗。
1、改善精子质量、无精子症或畸形精子症患者。提高精子能量的药物，如核苷酸、胰腺肽释放酶、锌剂、维生素e、a等，性激素类药物有克罗米酚、绒毛膜促性腺激素(HCG)、补肾益精的中药和中药等。
2、病因治疗。对于性病、前列腺炎、输精管炎、睾丸炎等生殖道感染，早期控制泌尿生殖系统的炎症对治疗和预防不育非常重要。
3、 男性功能障碍如阳萎、早泄、不射精、逆行射精等
4、 手术治疗，包括尿道下裂、包皮过长等。输精管再通吻合术、结核等所致的输精管梗阻，对于难以复通的输精管损伤可行睾丸或附睾取精，分离出精子行卵母细胞内单精子注射（ICSI）-胚胎移植（ET）
5、 辅助生殖技术治疗：
如果经过反复检查、治疗，确认不能生育的夫妇，必须冷静地面对现实，可以考虑做人工授精或试管婴儿。适用于无精症、少精症和弱精症患者，人工授精是用人工方法将精液注入女性生殖道，取代性交方式使女性怀孕的技术。精子库的精子也可以用丈夫的精子，人工授精被认为是安全有效的治疗不育症的方法。
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