1、慢性尿道炎或膀胱炎:其临床表现与慢性前列腺炎相似，但前列腺检查无异常。
2、前列腺疼痛:无实质性病变，表现为会阴部和耻骨上区疼痛和压痛，有排尿障碍等尿路表现。前列腺触诊正常，前列腺液镜检正常，前列腺液及尿液培养无细菌。
3、肉芽肿性前列腺炎，尽管症状、直肠指检易与慢性前列腺炎混淆，但前者进展快，可迅速发生尿潴留，短期内硬结生长较快。需要前列腺活体组织检查鉴别，组织学检查显示肉芽肿性反应。
4、卡特性前列腺炎或前列腺病(也称非细菌性前列腺炎)临床症状与慢性前列腺炎难以区别。会阴部疼痛不适，有排尿和功能障碍等表现。前列腺液检查卵磷脂小体多，白细胞增多，但涂层和细菌培养无细菌生长。
5、前列腺溢液(也称无菌前列腺炎、前列腺泄漏或慢性前列腺充血):大、小便结束时乳白色分泌物从尿道流出，经常合并精神症状。但直肠指检、前列腺液镜检查均正常，细菌学检查阴性。
6、前列腺癌:晚期可出现尿路症状。直肠指检发现前列腺有硬块，表面高低不平。前列腺液涂层、穿刺活检可发现癌细胞。
7、前列腺结石:出现腰骶部、会阴部疼痛、功能障碍、阳痿、早泄等症状。直肠手指检查可以接触到前列腺有结石摩擦感，骨盆x线平片有阳性结石的影子，可以进行资格鉴定。
8、前列腺结核。症状类似前列腺炎，但有结核病史。直肠是指前列腺呈不规则结节状，睾丸肿大变硬，输精管有串珠状硬结。前列腺液结核杆菌可直接涂片或结核杆菌培养找到结核杆菌，前列腺活体组织检查可见结核结节或干酶样坏死。
