肛窦炎
直肠炎未及时治疗时，可能引起肛窦炎等肛肠病，有继发肛周脓肿的危险。
肠狭窄
病程持续5-25年以上的患者大多发生，一般无症状征兆，严重时肠堵塞，本病肠狭窄时，要警惕肿瘤，及时鉴别良性恶性，对症治疗。
肠息肉、结肠恶变
直肠炎超过五年，肠道溃疡面会在炎症的长期刺激下容易异常增生，引发肠息肉，一厘米以上肠息肉恶变率极高。
肛门管炎
这是与直肠炎并发的最常见的疾病，与直肠炎并发被称为肛门管直肠炎，肛门管炎长期拖延也有恶化的危险。
缺铁性贫血
便血是本病的主要临床表现之一，便血的多少也是衡量病情的重要指标。长期慢性出血可引起缺铁性贫血。
