慢性扁桃体炎可引起肾炎、关节炎、风湿性心脏病、中耳炎等疾病，引起扁桃体周围脓肿，严重时可导致死亡。
一、引起其他疾病
慢性扁桃体炎主要表现是咽干、咽痛、咽部堵塞感、口臭等，反复发作可诱发慢性肾炎、风湿性心脏病、关节炎等。若炎症蔓延至周围组织和器官，可引起鼻窦炎、中耳炎、支气管炎等疾病。严重慢性扁桃体炎可导致扁桃体周围脓肿，严重时导致死亡。
二、影响免疫功能
扁桃体炎反复发作需切除扁桃体治疗，其是人体免疫器官，切除后影响免疫功能，导致咽腔扩大，引起喝水呛咳、咽部干燥、异物感等后遗症。
