长期使用热水袋可能会导致皮炎或烫伤，若是电热水袋，还有爆炸的危险。
热水袋使用时间如果过长，易诱发皮炎。这是因为长时间使用热水袋会加快皮肤中水分的流失，从而使皮肤变得干燥、瘙痒，导致皮肤过敏、诱发皮炎。尤其是老年人或者干性皮肤者，因此，使用电热水袋时也要注意补充水分。
热水袋如果使用不当，易造成低温烫伤。皮肤长时间与低温热源接触，会逐渐发展为真皮深层及皮下各层组织烫伤。低温烫伤创面疼痛感不十分明显，仅在皮肤上出现红肿、水泡、脱皮或者发白的现象，面积也不大。但严重者会造成深部组织坏死，如果处理不当，可能会发生溃烂，长时间都无法愈合。可在使用电热水袋时，适当控制温度，或在热水袋外面包裹一层毛巾，不直接接触使用者的皮肤。
电热水袋存在一定的爆炸隐患，尤其是电极式热水袋，因此应使用电热丝式电热水袋，并且在选择有信誉、大型的商家。
