肝内贮脂量占肝重5%以上或组织学表现为30% -50%以上的肝细胞脂肪变性即可诊断为“脂肪肝”。但在临床中多不能以肝组织活检来诊断，血液生化指标也难与脂肪肝病变程度一致，因此B超、cT、磁共振等影像学检测成为十分重要而实用的临床诊断手段。
(1)B超检查：弥漫性脂肪肝在B超图像上有其独特的表现，高回声斑点，人称之为“明亮肝”。肝脏轻度或中度肿大。B超可检出肝脂肪含量达30%以上的脂肪肝，肝脂肪含量达50%以上的脂肪肝，超声诊断敏感性可达90%。
(2)CT：CT值的高低与肝脂肪沉积量呈明显负相关，因脾脏CT值常较稳定，故肝/脾CT值的比值可作为衡量脂肪肝程度的参考标准。CT对脂肪肝的诊断具有优越性，其准确性优于B超，但费用昂贵及有放射性是其不足之处。
(3)磁共振(MRI)：磁共振及肝动脉造影主要用于超声及CT检查诊断困难者，特别是在局灶性脂肪肝难以与肝脏肿瘤鉴别时。
确诊脂肪肝的“金标准”是肝穿刺活检组织细胞学检查。但是对于肥胖者不必进行肝穿诊断。
