高位复杂性肛瘘手术也分为轻症和重症两种，对于正常的高位复杂性肛瘘手术，一般手术时间大约半个小时就可以完成，而对于严重的高位复杂性肛瘘手术得需要一个多小时的时间。高位复杂性肛瘘手术以后完全愈合需要差不多两个月的时间。
进行高位复杂性肛瘘手术时，需要进行麻醉，才能够使手术顺利进行。麻醉除了可以使患者少承受疼痛以外，还可以让肛门肌肉更加放松，有利于手术的进行。麻醉时间一般大约需要20分钟，就可以使患者完全放松，能够进行手术，正常的高位复杂性肛瘘手术治疗，时间大约用十分钟就能够完成。因此，综合起来正常的高位复杂性肛瘘手术时间为半小时。有的高位复杂性肛瘘手术症状比较严重，除了肛瘘情况复杂外，还需要在进行肛瘘手术的过程中，需要对直肠进行处理，这就延长了手术进行时间。因此重症的高位复杂性肛瘘手术比正常的高位复杂性肛瘘手术所用的时间要长，从麻醉开始到手术结束大约需要一个多小时的时间。
做完重症的高位复杂性肛瘘手术以后要想使手术伤口完全愈合，大约得需要两个月的时间。在此期间内患者一定要注意保持肛门消毒卫生工作，防止手术伤口感染化脓。
