少数会厌囊肿病情较轻微，这时有可能自愈。大多数会厌囊肿都会引起明显临床症状，这时并不能自愈，需要及时治疗改善病情。
一、少数会厌囊肿有可能自愈
有少数会厌囊肿并没有引起明显症状，也不会对身体造成影响。这时通过改变不良饮食习惯和生活习惯，保证充足睡眠等方式有可能促进病情自愈。另外，在进食或剧烈咳嗽时，有可能会刺破囊皮，使里面液体流出，这样也有可能出现自愈情况，不过很容易复发。
二、大多数会厌囊肿不能自愈
大多数会厌囊肿都无法自愈，尤其是比较大囊肿，需要及时进行相应治疗才能改善病情。通常都是进行手术治疗，将囊肿及囊皮彻底清除，这样可以减轻症状，改善喉咙异物感情况，也能够减少术后复发率。
