女性发生习惯性流产可能是遗传因素、母体患有疾病、免疫因素、内分泌因素等导致的。
1.遗传因素：在习惯性流产的女性中，约有2%-4%与遗传因素有关。比如有些女性是近亲结婚，很容易导致胚胎的染色体结构与数目发生异常，从而影响到胚胎的正常发育，出现习惯性流产。
2.母体患有疾病：女性患有妇科炎症，如盆腔炎、输卵管炎、子宫内膜炎以及患有内科疾病如肾病、甲状腺功能低下等，都可能引起习惯性流产。此外，女性的子宫发育出现异常，或者出现先天性子宫畸形，比如子宫过小、子宫肌瘤、子宫内膜受损等，也都会造成习惯性流产。
3.免疫因素：如果母体的血型与胎儿的不合，胎儿会从父亲方面获得抗原，进入母体后产生抗体，抗体可通过胎盘而进入胎儿的血液循环，在红细胞的作用下，可破坏溶血，严重时会导致胎儿死亡，引起流产。此外，还有一部分是由于母体的免疫系统将胎儿误认为是入侵的病毒而将其杀死，从而导致流产。
4.内分泌因素：想要维持胎儿正常的生长发育，需要内分泌激素发挥其调节和控制的作用，特别是孕酮，对维持妊娠有重要的作用，如果黄体功能不全，孕激素的合成变少，妊娠就难以维持，从而发生流产。
