有人说金针菇有毒，其实这种说法是片面的。因为只要是在正常环境条件下生产的金针菇，只要在加工的时候没有添加有害物质的话，不论是不是新鲜的金针菇，都不会有毒的。有些媒体说新鲜金针菇有毒，可能是把金针菜错当成金针菇了，而金针菜其实是黄花菜，新鲜的金针菜的确是含有有毒的秋水仙碱，一定要晒干后才能食用。金针菇与金针菜是两种食物，前者来自菌类，后者来自植物。
一般人群均可食用，适合气血不足、营养不良的老人、儿童、癌症患者、肝脏病及胃、肠道溃疡、心脑血管疾病患者食用。但是，其实金针菇也不是人人皆宜。金针菇性寒，脾胃虚寒、慢性腹泻的人应少吃；关节炎、红斑狼疮患者也要慎食，以免加重病情。
而且金针菇不太容易消化，吃的时候注意嚼烂点。
