对于小葱拌豆腐的争议有很多，有人说小葱拌豆腐有碍于营养的吸收，因为豆腐中含有丰富的蛋白质、钙等营养成分。而葱含有大量草酸，当豆腐与葱相拌时，豆腐中的钙与葱里的草酸结合形成白色沉淀物草酸钙，使豆腐中的钙质遭到破坏。草酸钙是使人体难以吸收的物体，如果长期食用小葱拌豆腐将会造成人体钙质缺乏导致抽筋、软骨症等现象。
经营养学家研究认为：豆腐含钙，小葱含草酸，二者融合生成白色沉淀物――草酸钙，不易被人体吸收。这不仅破坏了豆腐的营养价值，而且还可能在体内形成结石，危害人体健康。
但是也有另一种说法，长期食用小葱拌豆腐不易得草酸钙结石。因为绝大多数植物当中都含有草酸。在家庭餐桌上常见的蔬菜当中，草酸含量最高的自然是菠菜，小葱的草酸含量比较低，甚至是微不足道。草酸的威胁，不仅在于影响钙的吸收，更多的人担心它引起结石。许多医学研究发现，食物中的草酸吸收之后，尿液中的草酸排泄量也会明显上升。长期大量地排泄草酸，可能会增加草酸钙结石的危险。因此，经常吃富含钙的食品，才是减少肾结石发生的重要膳食措施。应当在吃蔬菜的同时多吃豆制品、芝麻酱、奶类等富含钙的食物，因为让草酸和钙在锅中结合沉淀，或者在消化道中结合而产生沉淀，就会减少草酸的吸收。如果按照吃低钙饮食的方法，把富含钙的食物和草酸截然地分开，反而会制造更多的机会让草酸被人体吸收，增加体内形成草酸钙的几率。
